低聚果糖是存在于人们经常食用的上千种天然植物中，如存在于香蕉、黑麦、大蒜、牛蒡、芦笋根茎、小麦、洋葱、马铃薯、雪莲果、菊芋、蜂蜜等中。美国国家环境测试局（NET）评估了低聚果糖在食物中的含量，测试的部分结果是：香蕉0.3%、大蒜0.6%、蜂蜜0.75%、黑麦0.5%。牛蒡中含3. 6%、洋葱中含2.8%、大蒜中含1%、黑麦中含0.7%，雪莲果中果寡糖含量为干物质的60%-70%，菊芋块茎中含量最为丰富，占块茎干重的70%-80%。

低聚果糖作为被研究最多、应用范围最广的益生元之一，低聚果糖已被证实是同时具有双歧因子和水溶性膳食纤维的双生理学特性的全天然配料，在世界范围内被200多个国家和地区政府所认可，并被广泛应用于食品、保健、医药、化妆品以及饲料领域。在中国市场，低聚果糖被政府批准为“保健食品”、“食品配料”以及“营养强化剂”等，相关功能性产品市场发展也非常迅猛。