氧化降解法：氧化降解法是近年来国内外研究比较多的壳聚糖降解方法。 其中的过氧化氢（H2O2）氧化降解因成本低、降解速度相对较快、产品分子量低且分布窄、无残毒、易实现工业化而倍受关注。其他氧化降解方法有紫外线辐射(UV)/H2O2，NaCl/H2O2等。

硼酸钠降解法：据报道此法制备过程简单，所得的壳寡糖不仅溶于水，而且在二甲乙酞胺和二甲亚矾等有机溶剂中有很好的溶解性。

物理方法

超声波法和微波法：此方法能够降低能耗，减少污染，节省时间和原料，具有产业化前景和广泛的市场潜力。

γ射线照射下辐射降解：辐射降解是在放射性射线照射下， 使壳聚糖分子产生电离或激发的物理效应，进而导致分子链断裂。