选择树龄4-6年生,长势旺盛,根系发达的树作为母株。2月上旬,刨开树根周围的土壤,切取笔杆粗的侧根,截成长18-20厘米的小段,作为插穗,插入苗床沟内深约10-13厘米。株距10-13厘米。插后施焦泥灰,覆细土,耙平,压实,浇少量人粪尿,铺盖稻草,以保持土壤湿润。一个月左右长出新芽后,再施稀人粪尿,以后看苗施肥。翌春苗高70厘米以上时,即可移栽。2-3年后便能开花结果。此法简便易行,繁殖快,成活率高达80%以上,而且生长快,结果早,因而是产地普遍采用的繁殖方法。
利用吴茱萸分蘖力强的特点,可在12月下旬选健壮母株,在其周围约0.6米处,挖开表土,使其露出侧根。在侧根上,每隔7-10厘米用刀砍伤根皮,然后覆厚5-7厘米的细土,再施腐熟厩肥或稀薄人粪尿。最后盏垃圾或稻草。翌年春,伤口处就会萌芽,出土后除去覆盖的稻草,施稀人粪尿。待苗稍大后,即可截取移栽。用此法繁殖简便,成活率高,但植株长势弱,结果少,产量低。