研究表明，牡蛎肉中富含多种矿物质及微量元素，其中钙含量为40-94.04mg/g，铁为5.50-8.00 mg/g，硒为49.00 mg/g，锌为22.54 mg/g。牡蛎肉（干品）提取物中牛磺酸含量为50.6 mg/g，其含量远高于蛤、鱿鱼、海参等其它海产品。

渤海湾密鳞牡蛎具有富含牛磺酸（50μmol/g）、锌、硒等特点；低脂肪、，含有一定量的高度不饱和脂肪酸（EPA+DHA占脂肪总量的20.4%），无机盐、维生素含量也很丰富。太平洋牡蛎、僧帽牡蛎和近江牡蛎中皆含有人体所有8种必须氨基酸，其中含量的都是赖氨酸，这对平衡国民膳食中氨基酸比例具有重要意义。三种牡蛎中牛磺酸的含量分别高达7.542、4.388和和3.591mg/g，几乎超过其他游离氨基酸含量的总和

壳在断面上可以分为三层；最外层为薄而透明的角质层，中层最厚是由碳酸钙组成的柱状结构称棱柱层，内层为碳酸钙的片状结构，称珍珠层。壳是由下面的外套膜分泌形成，外套膜由壳顶处向腹缘延伸，它是两层上皮细胞，中间夹有结缔组织所形成的膜，膜内有肌纤维使它附着在壳内面，外套膜的边缘加厚形成三个褶皱，内褶上有放射肌及环肌使边缘紧贴壳上。中褶上有大量的感觉细胞或感觉器，具有触觉、视觉等功能。外褶有很强的分泌功能。